صفحه اول >آرشیو تحقیقات
 
مقايسه بيولوژيكي و مولكولي جدايه هاي ويروس موزائيك رگه اي گندم در ايران

بدليل اهميت بيماري موزائيك رگه اي گندم در ايران، شناخت استرين هاي ويروس عامل بيماري براي درك اپيدميولوژي ضروري مي نمايد. در اين تحقيق تعدادي از جدايه‌هاي ايران از مناطق مختلف كشور شامل نقده، خوي، قروه، وينسار كردستان، تندران اصفهان، شيراز، سپيدان، سده (اقليد)، مرودشت و نشابور از گندم يا گياهان ديگر جمع آوري گرديد و پس از تشخيص ويروس، ترادف ناحيه 3`-UTR ژنوم ويروس تعيين گرديد. براي اين كار RNA وروس با m RNA capture Kit جذب و cDNA با آغازگر (oligodT) RCFI تهيه و PCR با جفت آغازگر اختصاصي WSMI-WSM2 انجام شد. قطعه تكثير شده در پلاسميد Z52R/T وارد و در باكتري E.coli DH5a همسانه سازي شد. پلاسميد همسانه سازي شده استخراج و ترادف قطعه وارد شده تعيين گرديد. ترادف هاي به دست آمده بررسي و با ترادف ساير استرين هاي موجود در Gen Bank مربوط به اروپا، آمريكا و تركيه همرديف سازي چندگانه (multiple alignment) انجام شد و درخت فيلوژنتيكي ترسيم گرديد. بر اساس رابطه فيلوژنتيكي مشخص شد كه كليه استرين ها و جدايه هاي دنيا منشأ مشتركي دارند و از منطقه هلال حاصلخيز سرچشمه گرفته‌اند. بر اين اساس كليه ترادف ها در چهار گروه قرار مي گيرند:

  1. استرين هاي اروپايي- آسيايي (Euroasia) كه جدايه هاي قروه، خوي، زنجان و نقده را نيز شامل مي شود.
  2. استرين هاي آمريكايي و تركيه.
  3. جدايه هاي فلات مركزي و جنوبي ايران شامل تندران اصفهان، وينسار، مرودشت، سده، شيراز، سپيدان و نيشابور.
  4. جدايه مكزيكي El Batan 3 كه يك جدايه كاملاً واگراست.

اين بررسي نشان داد كه منشأ استرين هاي آمريكايي، تركيه و منشأ استرين هاي اروپايي، شمال غرب ايران مي باشد و نيز مشخص شد كه دو خط سير تكاملي در ايران در اين ويروس وجود دارد يكي شمال غرب كشور و ديگري فلات مركزي و جنوبي ايران كه تمام اين جدايه ها جد مشتركي دارند و بر اساس جداسازي جغرافيايي در دو مسير تكاملي واگرا شده اند. اين نتايج مي تواند در برنامه هاي يافتن ژن هاي مقاوم و اصلاح گندم مفيد باشد